EM算法(期望最大化算法,Expectation-Maximization Algorithm)是一种迭代优化技术,广泛用于含有隐变量(latent variables)的概率模型参数估计。EM算法的目标是找到模型参数的最大似然估计,尤其是当模型中存在无法直接观测的隐藏数据时。它通过迭代两个步骤来逼近最大似然解:E步(期望步)和M步(最大化步)。

1、理解EM算法

EM算法(Expectation-Maximization)是一种迭代优化技术,主要用于参数估计问题,特别是在统计模型中存在未观察到的隐变量或数据不完整时。通过交替执行两个步骤——期望步(E步)和最大化步(M步)——EM算法逐步改进对参数的估计。在E步,算法计算当前参数估计下隐变量的期望,相当于对隐变量进行一个“软”分配;而在M步,根据E步的结果更新参数,以最大化观测数据的似然函数。这个过程类似于“猜测-验证”,不断迭代以改进参数估计,直到收敛。

EM算法的优势在于其广泛的适用性和对隐变量处理的灵活性,能够保证似然函数的值在迭代过程中不减少,从而确保收敛性。然而,算法可能收敛到局部最大值,并且初始化参数的选择、迭代停止的标准等实践中的问题需要特别注意。EM算法在高斯混合模型(GMM)、聚类、分类以及缺失数据处理等多个领域有着广泛应用,尽管面临挑战,其在处理含隐变量的复杂问题中的有效性仍被广泛认可。

2、scikit-learn

Python中,使用scikit-learn库可以通过高斯混合模型(Gaussian Mixture Model, GMM)来实现期望最大化(Expectation-Maximization, EM)算法。GaussianMixture类提供了使用EM算法估计参数的功能,适用于聚类和密度估计等任务。

1)安装命令

pip install scikit-learn

2)导入所需模块

from sklearn.mixture import GaussianMixture
from sklearn.datasets import make_blobs
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

3、数据集

Scikit-learn 的 EM 算法通常用于聚类分析,比如使用高斯混合模型(Gaussian Mixture Model, GMM)。糖尿病数据集(Diabetes Dataset)是 Scikit-learn 库中的一个标准数据集,用于回归分析。尽管这个数据集通常用于回归任务,可以尝试使用 EM 算法对其进行聚类分析,从而发现数据中潜在的模式或组别。数据集包含了442个病人的10个基线变量,目标变量是一年后疾病进展的量化度量。这些基线变量包括年龄、性别、体质指数、平均血压和六个血清测量值。Python 的 scikit-learn 库中,可以直接加载并使用这个数据集。

糖尿病数据集的特征:

特征

描述

年龄 (age)

年龄

性别 (sex)

性别

体质指数 (bmi)

体质指数

平均血压 (bp)

平均血压

S1 (总血清胆固醇)

总血清胆固醇

S2 (低密度脂蛋白胆固醇)

低密度脂蛋白胆固醇

S3 (高密度脂蛋白胆固醇)

高密度脂蛋白胆固醇

S4 (总胆固醇 / 高密度脂蛋白胆固醇)

总胆固醇 / 高密度脂蛋白胆固醇

S5 (血清甲状腺素水平的对数)

血清甲状腺素水平的对数

S6 (一年后的血糖水平)

一年后的血糖水平

使用代码,

from sklearn.datasets import load_diabetes
import numpy as np

# 加载糖尿病数据集
X, y = load_diabetes(return_X_y=True)

# 查看数据维度
print("特征集维度:", X.shape)
print("响应变量维度:", y.shape)

# 打印前5个样本的特征和目标值,以便观察数据
print("前5个样本的特征:\n", X[:5])
print("前5个样本的目标值:", y[:5])

5、使用EM算法聚类分析

Scikit-learn 的 EM 算法通常用于聚类分析,比如使用高斯混合模型(Gaussian Mixture Model, GMM)。糖尿病数据集(Diabetes Dataset)是 Scikit-learn 库中的一个标准数据集,用于回归分析。尽管这个数据集通常用于回归任务,可以尝试使用 EM 算法对其进行聚类分析,从而发现数据中潜在的模式或组别。使用 Scikit-learn 的 GaussianMixture 类在糖尿病数据集上应用 EM 算法。常用参数如下,

参数名描述
n_components模型中的组件数
(即高斯分布的数量,也可以理解为聚类的数量)。
默认值为 1
covariance_type协方差参数类型。
可选值有 'full'(每个组件有自己的一般协方差矩阵)
'tied'(所有组件共享一个协方差矩阵)
'diag'(每个组件有自己的对角协方差矩阵)
'spherical'(每个组件的协方差矩阵是由单个方差组成,
假设特征之间不相关)。默认值为 'full'
random_state随机数生成器的种子。
用于结果的可重现性。如果为None
则随机数生成器是np.random
使用的RandomState实例。默认值为None
tolEM算法的收敛阈值。算法会停止迭代,
如果在两次迭代之间的对数似然下降小于此阈值。
默认值为 1e-3。
max_iterEM算法的最大迭代次数。默认值为 100。
n_init初始化次数。算法会运行n_init次,
并选择具有最大似然的结果。默认值为 1。
init_params参数初始化方法。
可选值有'kmeans'
(使用k-means算法初始化)
'random'(随机初始化)。
默认值为'kmeans'

使用代码,

from sklearn.datasets import load_diabetes
from sklearn.mixture import GaussianMixture
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

# 加载糖尿病数据集
X, y = load_diabetes(return_X_y=True)

# 数据标准化
scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

# 应用高斯混合模型聚类
n_components = 2  # 假设我们想要将数据聚类为2个组
gmm = GaussianMixture(n_components=n_components, random_state=0)
gmm.fit(X_scaled)

# 预测每个点的簇标签
labels = gmm.predict(X_scaled)

# 可视化结果(选择前两个特征进行可视化)
plt.scatter(X_scaled[:, 0], X_scaled[:, 1], c=labels, cmap='viridis')
plt.xlabel('Feature 1')
plt.ylabel('Feature 2')
plt.title('Cluster assignment with GMM')
plt.draw()
plt.show()

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